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上海生科院發(fā)表環(huán)形RNA研究綜述文章

作者: 2016年03月04日 來源:互聯(lián)網(wǎng) 瀏覽量:
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2月25日,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所研究員陳玲玲受邀在Nat Rev Mol Cell Biol 上發(fā)表題為The biogenesis and emerging roles of circular RNAs 的綜述進(jìn)展論文

  2月25日,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所研究員陳玲玲受邀在Nat Rev Mol Cell Biol 上發(fā)表題為The biogenesis and emerging roles of circular RNAs 的綜述進(jìn)展論文,對環(huán)形RNA這一類具有特殊結(jié)構(gòu)的RNA分子新家族的生成加工及潛在生物學(xué)功能進(jìn)行了系統(tǒng)總結(jié)和研究展望。

  傳統(tǒng)的編碼和非編碼RNA研究主要針對呈5→3極性的線形RNA開展,而非poly(A)轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)合全新的計算生物學(xué)算法揭示了生物體內(nèi)存在大量的環(huán)形RNA,主要包括內(nèi)含子來源和外顯子反向剪接來源的兩類環(huán)形RNA。陳玲玲研究組與中國科學(xué)院-馬普學(xué)會計算生物學(xué)伙伴研究所楊力研究組合作,與國際上其他研究組共同闡明了外顯子環(huán)形RNA的產(chǎn)生需要經(jīng)典的剪接復(fù)合體,并同時受到順式作用元件和反式作用因子的調(diào)控。更為重要的是,由于其結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,這些環(huán)形RNA在體內(nèi)可以長期穩(wěn)定存在,具有成為新型生物標(biāo)志物的潛在應(yīng)用價值。雖然大部分環(huán)形RNA的功能作用仍有待進(jìn)一步揭示,已有的研究表明環(huán)形RNA可以通過結(jié)合RNA聚合酶II在轉(zhuǎn)錄水平、或作為分子海綿結(jié)合miRNA在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達(dá)。迄今為止,組學(xué)研究預(yù)測到多達(dá)幾十萬條的環(huán)形RNA,深入揭示它們在不同條件下的生物加工特性及其潛在功能作用,將進(jìn)一步豐富人們對環(huán)形RNA這一類RNA新分子的認(rèn)知和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)應(yīng)用。

  陳玲玲研究組從事長非編碼RNA研究,近年來揭示細(xì)胞核內(nèi)非編碼RNA參與基因表達(dá)調(diào)控的機制(Genes Dev, 2015; Cell Res, 2014, 2015);也首次創(chuàng)建非poly(A)轉(zhuǎn)錄組純化體系(Genome Biol, 2011),系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)一系列新RNA分子家族,揭示其生成加工機制及生物學(xué)功能,其中包括sno-lncRNAs (Mol Cell, 2012; NAR, 2015)、內(nèi)含子來源環(huán)形RNA (Mol Cell, 2013)及外顯子反向剪接環(huán)形RNA (Cell, 2014)。相關(guān)研究極大地推動了長非編碼RNA和環(huán)形RNA研究領(lǐng)域的發(fā)展。



 

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標(biāo)簽:環(huán)形RNA

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